Nonostante oggi non si possa più ammirare l’antico panorama boschivo che un tempo caratterizzava gli altopiani centrali dell’isola, essa possiede ancora un patrimonio naturalistico eccezionalmente importante, che presenta interessanti caratteristiche soprattutto dal punto di vista della biodiversità.

Ad un panorama tipico delle isole mediterranee, e quindi la presenza di arbusti e piante tipiche delle coste meridionali dell’Europa, si aggiungono infatti diverse componenti, soprattutto nella flora, che sono di sicura provenienza africana.

La sua posizione isolata e per lungo tempo tranquilla ne ha poi fatto il luogo d’elezione di alcune specie di rettili marini, come le celebri tartarughe Caretta Caretta, che hanno in Lampedusa, ed in particolare la celebre spiaggia di fronte all’Isola dei Conigli, il luogo in cui approdare durante la deposizione delle uova.

Anche il panorama faunistico dei fondali è di notevole importanza e bellezza, perchè alle specie tipiche del mediterraneo, tra cui si annoverano anche il pesce spada ed il tonno, oltre ai grandi pesci mammiferi come il delfino e persino le balene, si aggiungono pesci provenienti dai mari africani, giunti qui a causa dell’innalzamento della temperatura media del mare. E’ per questo motivo che l’isola è un appuntamento imperdibile per gli appassionati di immersioni.

Degli antichi grandi mammiferi, di cui un tempo c’era traccia sull’isola, non è rimasto più alcun esemplare, sebbene permangono in tutta la prateria i piccoli roditori, preda ed alimento di una ricca fauna avicola, che comprende soprattutto specie rapaci come il falco.